Magistriõppes toimub spetsialiseerumine vastavalt psühholoogia osakonna uurimisteemadele. Võimalik on spetsialiseeruda psühhofüüsikale, eksperimentaal-, neuro-, arengu-, kliinilisele-, isiksuse-, sotsiaal- või rakenduspsühholoogia erialale. Magistrieksamiks tuleb läbi töötada psühholoogilist kirjandust, mille tingmahuks on 10 viiesaja leheküljelist monograafiat ehk 5000 lehekülge teaduslikku teksti. Magistriõppe kohustusliku kirjanduse loetelu kinnitab igaks aastaks psühholoogia osakonna nõukogu. 

Magistritööks tuleb esitada vähemalt ühe teadusliku artikli mahus uurimus, mis on kas juba avaldatud mõnes rahvusvahelise levikuga ajakirjas-kogumikus või on toimetusele esitatud seal avaldamiseks. Erandina võetakse kaitsmisele töid, mille tulemused on ilmunud kohaliku levikuga väljaannetes, kuid sisaldavad originaalset teaduslikku ideed ning omavad tähtsust psühholoogia kui teadusele või kui elukutsele.